RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 TUBBP07437 444 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CFHP08603 1231 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CTSHP09668 335 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNE1P15382 129 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CD19P15391 556 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RAD23BP54727 409 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 C2orf54Q08AI8 447 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MGAT3Q09327 533 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB6Q15916 424 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PTGISQ16647 500 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PTPROQ16827 1216 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF394Q53GI3 561 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 XKR4Q5GH76 650 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 HACE1Q8IYU2 909 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM130Q8N3G9 435 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM35BQ8NCS4 154 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 WNT8BQ93098 351 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MS4A14Q96JA4 679 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS6KC1Q96S38 1066 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 GDF15Q99988 308 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CHST12Q9NRB3 414 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PARP2Q9UGN5 583 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 IPPQ9Y573 584 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP83Q9Y592 693 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ALG6Q9Y672 507 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 EYSQ5T1H1 3165 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH10P35580 1976 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 GRIN2DO15399 1336 aa11.04□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CITO14578 2027 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP104O60308 925 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CHRNA1P02708 482 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CALB1P05937 261 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RHOXF2BP0C7M4 288 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SYN1P17600 705 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RRM1P23921 792 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 AKAP5P24588 427 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 THPOP40225 353 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ACLYP53396 1101 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CDH8P55286 799 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 INCA1Q0VD86 236 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 PTK7Q13308 1070 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGA7Q13683 1181 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MESDQ14696 234 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TFAP2BQ92481 460 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF560Q96MR9 790 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 RHOXF2Q9BQY4 288 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCL16Q9H2A7 254 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 EPC1Q9H2F5 836 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 EHD2Q9NZN4 543 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SCINQ9Y6U3 715 aa11.03□□□□□ -0.64
GTPBP1-211ENST00000487538 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PPC1 479 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 GPR182O15218 404 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 CAND2O75155 1236 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP3A5P20815 502 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 COMTP21964 271 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 MMP8P22894 467 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 MCM3P25205 808 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 PNPLA4P41247 253 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 CLCN6P51797 869 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 PTP4A2Q12974 167 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 BRD3Q15059 726 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 CLUL1Q15846 466 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.02□□□□□ -0.65
GTPBP1-211ENST00000487538 USP38Q8NB14 1042 aa11.02□□□□□ -0.65
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