RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485567.1

FN1-222, Transcript of fibronectin 1, human

TSL 1 (best)

Gene FN1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FN1-222	ENST00000485567	RAD17	O75943	681 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	INMT	O95050	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MYL4	P12829	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GCSH	P23434	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PAX3	P23760	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SLC6A2	P23975	617 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	IL1R2	P27930	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CCT5	P48643	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MED25	Q71SY5	747 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567		M0QYG6	137 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	KCNQ3	O43525	872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	A1BG	P04217	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ITGB1	P05556	798 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	HSD3B1	P14060	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FOXL1	Q12952	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ELF2	Q15723	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZACN	Q401N2	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	HESX1	Q9UBX0	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NPHP1	O15259	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CCP110	O43303	1012 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RASSF9	O75901	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PRSS23	O95084	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	KIF20A	O95235	890 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	RENBP	P51606	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CHN2	P52757	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	COPA	P53621	1224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PIGF	Q07326	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FOXO1	Q12778	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GRM1	Q13255	1194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	METRNL	Q641Q3	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	HTR3D	Q70Z44	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MUL1	Q969V5	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	SNX27	Q96L92	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	PNKP	Q96T60	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FN1-222	ENST00000485567	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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