RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 TCP11X2Q5H9J9 407 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CD300LGQ6UXG3 332 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SV2AQ7L0J3 742 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 USP37Q86T82 979 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF214Q8ND24 703 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CXorf38Q8TB03 319 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35C1Q96A29 364 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TIFAQ96CG3 184 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 UROC1Q96N76 676 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 COLEC11Q9BWP8 271 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CYLDQ9NQC7 956 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MARCH5Q9NX47 278 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TAB2Q9NYJ8 693 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SIX4Q9UIU6 781 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MYO7AQ13402 2215 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 I3L4J1 428 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 PIRO00625 290 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 STX10O60499 249 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRN2O75325 713 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TADA2AO75478 443 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 B3GAT3O94766 335 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 KIF4AO95239 1232 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-DRAP01903 254 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP1A3P13637 1013 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF18P17022 549 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 BRCC3P46736 316 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 FMO5P49326 533 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 AP3M2P53677 418 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MYL6P60660 151 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ERVK-21P61565 698 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 RBP5P82980 135 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ENPEPQ07075 957 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TRPC3Q13507 836 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT31Q15323 416 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ZACNQ401N2 412 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CBWD6Q4V339 395 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 EPC2Q52LR7 807 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CBWD3Q5JTY5 395 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CBWD5Q5RIA9 395 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC39A11Q8N1S5 342 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 RBSNQ9H1K0 784 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 VPS16Q9H269 839 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SPG21Q9NZD8 308 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ITGA11Q9UKX5 1188 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 ANO9A1A5B4 782 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 EPOPA6NHQ4 379 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 RFXAPO00287 272 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 FGF18O76093 207 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CLSTN1O94985 981 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 CSPG5O95196 566 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF2H1P32780 548 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 PIK3CAP42336 1068 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TAF6P49848 677 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MXI1P50539 228 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TPM4P67936 248 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MYL7Q01449 175 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 NCOA4Q13772 614 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MAN2A1Q16706 1144 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 VWA3BQ502W6 1294 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 MIIPQ5JXC2 388 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 KRT39Q6A163 491 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS1R2Q8TE23 839 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA4DQ92854 862 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD28-208ENST00000463533 IGSF21Q96ID5 467 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms