RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 LPIN3Q9BQK8 851 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 LRFN3Q9BTN0 628 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR70Q9NW82 654 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP72Q9P209 647 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 L1RE1Q9UN81 338 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CLUHO75153 1309 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGEF37A1IGU5 675 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MTMR11A4FU01 709 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 KPNA7A9QM74 516 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C4K7 107 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 DCXO43602 365 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP2C2O75185 946 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 AKAP3O75969 853 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 TWF1Q12792 350 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 BFSP1Q12934 665 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 DUSP4Q13115 394 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 PDXDC1Q6P996 788 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 STKLD1Q8NE28 680 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 APPL2Q8NEU8 664 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ING5Q8WYH8 240 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 NECTIN4Q96NY8 510 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PKMYT1Q99640 499 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CGRRF1Q99675 332 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC3Q9BY71 257 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN1B1Q9UKM7 699 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 POLIQ9UNA4 740 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PDXKO00764 312 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 GABRDO14764 452 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 NARSO43776 548 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOC3O60645 756 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR37L1O60883 481 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 RHOP08100 348 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 ODC1P11926 461 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CPB1P15086 417 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 GJA1P17302 382 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CEBPBP17676 345 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TNNI1P19237 187 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 GPR15P49685 360 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 MYL6P60660 151 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGEF1-206ENST00000461017 GPR17Q13304 367 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 MYBPC2Q14324 1141 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PTPN21Q16825 1174 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 DUOXA2Q1HG44 320 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TPGS2Q68CL5 300 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP26C1Q6V0L0 522 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-206ENST00000461017 TMC8Q8IU68 726 aa7.54□□□□□ -1.2
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