RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450875.5

CITED1-208, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-208ENST00000450875 ADCY1Q08828 1119 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 NCOA4Q13772 614 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ZNF699Q32M78 642 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 WSCD1Q658N2 575 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 RTL10Q7L3V2 364 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 DPH6Q7L8W6 267 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GPR149Q86SP6 731 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ELMOD1Q8N336 334 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 MLKLQ8NB16 471 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ZNF516Q92618 1163 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SNX25Q9H3E2 840 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SIX4Q9UIU6 781 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 FBXW11Q9UKB1 542 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 MAFFQ9ULX9 164 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 NR2E1Q9Y466 385 aa8.7□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 CCL16O15467 120 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TBC1D4O60343 1298 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ABLIM3O94929 683 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GNA14O95837 355 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TRIM49P0CI25 452 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TRIM49CP0CI26 452 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 BMP6P22004 513 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PCSK1P29120 753 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 HOXA9P31269 272 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ALDH1A3P47895 512 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GCLMP48507 274 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 MYL6P60660 151 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 CLDN10P78369 228 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ENPEPQ07075 957 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SMARCB1Q12824 385 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GPR17Q13304 367 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SLC39A12Q504Y0 691 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 KRT39Q6A163 491 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 IQCEQ6IPM2 695 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SV2AQ7L0J3 742 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GPT2Q8TD30 523 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PLEKHO2Q8TD55 490 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 BORCS6Q96GS4 357 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 CEP63Q96MT8 703 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 MYO7AQ13402 2215 aa8.69□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 VWA8A3KMH1 1905 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 DLL1O00548 723 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 STAU1O95793 577 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PDGFRBP09619 1106 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 CCDC192P0DO97 292 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PTMSP20962 102 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GTF2H1P32780 548 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 MXI1P50539 228 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 EPHB3P54753 998 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 NLRP12P59046 1061 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TWF1Q12792 350 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 CETN1Q12798 172 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 DUSP4Q13115 394 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 PLD1Q13393 1074 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 TAF12Q16514 161 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 ZACNQ401N2 412 aa8.68□□□□□ -1.02
CITED1-208ENST00000450875 WDR44Q5JSH3 913 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms