RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
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USP46-201ENST00000441222 CENPAP49450 140 aa6.96□□□□□ -1.29
USP46-201ENST00000441222 KIZQ2M2Z5 673 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP46-201ENST00000441222 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.96□□□□□ -1.29
USP46-201ENST00000441222 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.96□□□□□ -1.29
USP46-201ENST00000441222 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.96□□□□□ -1.29
USP46-201ENST00000441222 KLHL31Q9H511 634 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP46-201ENST00000441222 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 XKR3Q5GH77 459 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 SPATA18Q8TC71 538 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 MAML3Q96JK9 1138 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.96□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 NEO1Q92859 1461 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 PNPLA4P41247 253 aa6.96□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.96□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 PDP2Q9P2J9 529 aa6.96□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 133.7
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USP46-201ENST00000441222 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.96□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 C1orf54Q8WWF1 131 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP46-201ENST00000441222 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.95□□□□□ -1.3
USP46-201ENST00000441222 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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