RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 OSBPL6Q9BZF3 934 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF233A6NK53 670 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 HUS1O60921 280 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 ITGB3P05106 788 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 PSMC3P17980 439 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 MAGEA9P43362 315 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 TEAD2Q15562 447 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 E2F4Q16254 413 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 WSCD1Q658N2 575 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 PSMG2Q969U7 264 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 FOXQ1Q9C009 403 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC78-204ENST00000439619 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 A0A1W2PRU2 124 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 MAN2B1O00754 1011 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 KRT19P08727 400 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 RBP5P82980 135 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 MYO1EQ12965 1108 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 SHC4Q6S5L8 630 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 C1orf210Q8IVY1 113 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 YAF2Q8IY57 180 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM209Q96SK2 561 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 FAM170BA6NMN3 283 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF263O14978 683 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 VNN2O95498 520 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 TNNC2P02585 160 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 GJA1P17302 382 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 FCARP24071 287 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 MYL7Q01449 175 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 GRM2Q14416 872 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 TMEM86AQ8N2M4 240 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 DNAJC25Q9H1X3 360 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa20.25■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 DPYSL4O14531 572 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 MOSPD3O75425 235 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 CDC25CP30307 473 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 GDI1P31150 447 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 BFSP1Q12934 665 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 SPATA18Q8TC71 538 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 BORCS6Q96GS4 357 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 UBE4BO95155 1302 aa20.24■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 GABRR2P28476 465 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 VITQ6UXI7 678 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 UNC13DQ70J99 1090 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 TMC8Q8IU68 726 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 ACBD6Q9BR61 282 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 LRRC3Q9BY71 257 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC78-204ENST00000439619 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms