RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428316.1

RPSAP46-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 46, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP46, Length 882 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP46-201ENST00000428316 LRG1P02750 347 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CPB1P15086 417 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PNPLA4P41247 253 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 VCPP55072 806 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CYP24A1Q07973 514 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PSMD6Q15008 389 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SURF1Q15526 300 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SV2CQ496J9 727 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 WDR49Q8IV35 697 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 FSIP1Q8NA03 581 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PKMYT1Q99640 499 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CORO1BQ9BR76 489 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TMLHEQ9NVH6 421 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 HSFX1Q9UBD0 423 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 WNT16Q9UBV4 365 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 L1RE1Q9UN81 338 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SOAT2O75908 522 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 RHOBTB3O94955 611 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 AVPR2P30518 371 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CDR1P51861 262 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CLDN10P78369 228 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 NUCB2P80303 420 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SOWAHAQ2M3V2 549 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC39A12Q504Y0 691 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 OSTM1Q86WC4 334 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TMC8Q8IU68 726 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC9A9Q8IVB4 645 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 MCRS1Q96EZ8 462 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ZSWIM3Q96MP5 696 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF560Q96MR9 790 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 YIPF1Q9Y548 306 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TCHHQ07283 1943 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 KRBA1A5PL33 1030 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 HCRTO43612 131 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 KRT19P08727 400 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SRFP11831 508 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CEBPBP17676 345 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CYP2J2P51589 502 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 GPC5P78333 572 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 KCNB1Q14721 858 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 METTL23Q86XA0 190 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 THEM5Q8N1Q8 247 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TOP6BLQ8N6T0 577 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ING5Q8WYH8 240 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CGRRF1Q99675 332 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ACBD6Q9BR61 282 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 KCNH6Q9H252 994 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 EXOC1Q9NV70 894 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 GDE1Q9NZC3 331 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SNX9Q9Y5X1 595 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PDXKO00764 312 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF197O14709 1029 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PI15O43692 258 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CFHP08603 1231 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM191BP0C7N4 346 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 DLATP10515 647 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 GJA1P17302 382 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ATF6P18850 670 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 FCARP24071 287 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 LMO2P25791 158 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CASP4P49662 377 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SMARCB1Q12824 385 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TANGO2Q6ICL3 276 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 FAM171BQ6P995 826 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 DPH6Q7L8W6 267 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM86AQ8N2M4 240 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TMEM105Q8N8V8 129 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PRSS33Q8NF86 280 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 SHKBP1Q8TBC3 707 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 GPR152Q8TDT2 470 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 PARD3BQ8TEW8 1205 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 HPDLQ96IR7 371 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP46-201ENST00000428316 NME7Q9Y5B8 376 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms