RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM81BQ96LP2 452 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ADAM7Q9H2U9 754 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 USTQ9Y2C2 406 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 NR2E1Q9Y466 385 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TCHHQ07283 1943 aa9.58□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 HIDE1A8MVS5 230 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 P4HA2O15460 535 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TEX28O15482 410 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PHACTR2O75167 634 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ATF2P15336 505 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 IRS1P35568 1242 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PBX3P40426 434 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PRCPP42785 496 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CYP2J2P51589 502 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 MYL7Q01449 175 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 MORC3Q14149 939 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 LILRA6Q6PI73 481 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SPRED2Q7Z698 418 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ELMOD1Q8N336 334 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PPM1EQ8WY54 764 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 NXPE3Q969Y0 559 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SAAL1Q96ER3 474 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SENP8Q96LD8 212 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ACBD6Q9BR61 282 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 NUP62CLQ9H1M0 184 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CLSTN2Q9H4D0 955 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 IGFLR1Q9H665 355 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 EHD2Q9NZN4 543 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ASB3Q9Y575 518 aa9.57□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TRANK1O15050 2925 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SOBPA7XYQ1 873 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CYB561D2O14569 222 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CLIC2O15247 247 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TBC1D4O60343 1298 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TACC1O75410 805 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 MICAL2O94851 1124 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ABLIM3O94929 683 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 NFICP08651 508 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 KRT19P08727 400 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CCDC192P0DO97 292 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 KCNA5P22460 613 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CASP1P29466 404 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 VAMP7P51809 220 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TSPY1Q01534 308 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 BFSP1Q12934 665 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PAK1Q13153 545 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 GPR17Q13304 367 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SEZ6Q53EL9 994 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CEP135Q66GS9 1140 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TCEAL8Q8IYN2 117 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SPPL2BQ8TCT7 592 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 HPS3Q969F9 1004 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 HPDLQ96IR7 371 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 SPSB2Q99619 263 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ABCB6Q9NP58 842 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 LMBRD1Q9NUN5 540 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 HCSTQ9UBK5 93 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.56□□□□□ -0.88
PAICSP3-201ENST00000428007 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms