RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426538.6

GINS3-203, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-203ENST00000426538 TBX21Q9UL17 535 aa16.1■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 LRFN2Q9ULH4 789 aa16.1■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 CEP83Q9Y592 693 aa16.1■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 PODXLO00592 558 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 SPTLC1O15269 473 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 BUB1O43683 1085 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 NDST1P52848 882 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 GPC5P78333 572 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 TUSC3Q13454 348 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 ABI1Q8IZP0 508 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 OR6B3Q8NGW1 331 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 WHAMMQ8TF30 809 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 UROC1Q96N76 676 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 KIAA1257Q9ULG3 409 aa16.09■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 FAM170AA1A519 330 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 CTAGE9A4FU28 777 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 INPPL1O15357 1258 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 MOCS3O95396 460 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 VDRP11473 427 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 UPP1Q16831 310 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 NOMO2Q5JPE7 1267 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 UNC93AQ86WB7 457 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 PASD1Q8IV76 773 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 MCOLN1Q9GZU1 580 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 SNX25Q9H3E2 840 aa16.08■□□□□ 0.17
GINS3-203ENST00000426538 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 A8MXQ7 604 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CYB561D2O14569 222 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 RFC2P35250 354 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 ORC1Q13415 861 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 SGO2Q562F6 1265 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 TWNKQ96RR1 684 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 THAP2Q9H0W7 228 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 SALL4Q9UJQ4 1053 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.08■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 B3GAT3O94766 335 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 FAM163BP0C2L3 166 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 FGFR1P11362 822 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 PAX3P23760 479 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 IKBKEQ14164 716 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 NAA35Q5VZE5 725 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 RFFLQ8WZ73 363 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 TFAP2BQ92481 460 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 TRIM11Q96F44 468 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 L1RE1Q9UN81 338 aa16.07■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 HOXA2O43364 376 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CFHP08603 1231 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 NOMO3P69849 1222 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CENPCQ03188 943 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 STILQ15468 1287 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CNGA2Q16280 664 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 RABGGTAQ92696 567 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 SENP8Q96LD8 212 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.06■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 URI1O94763 535 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 TIMP1P01033 207 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 PDGFRBP09619 1106 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 MYBL1P10243 752 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 RAG1P15918 1043 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 ACOT1Q86TX2 421 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 ZNF653Q96CK0 615 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GINS3-203ENST00000426538 LHX5Q9H2C1 402 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms