RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN2P17706 415 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 NR2F2P24468 414 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 AP3M2P53677 418 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPC3Q13507 836 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ISM2Q6H9L7 571 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPPQ6IPU0 288 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DPH6Q7L8W6 267 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRTM3Q86VH5 581 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TOP6BLQ8N6T0 577 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ATAD1Q8NBU5 361 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ANK1P16157 1881 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MTMR11A4FU01 709 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DLG4P78352 724 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TWF1Q12792 350 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TMC2Q8TDI7 906 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 EDAQ92838 391 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPK13O15264 365 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP3O75969 853 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ASGR2P07307 311 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 LHX1P48742 406 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CDR1P51861 262 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ZXDAP98168 799 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PTPN21Q16825 1174 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ELMOD1Q8N336 334 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ITFG1Q8TB96 612 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MMS19Q96T76 1030 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ACBD6Q9BR61 282 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP72Q9P209 647 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRDO14764 452 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 IKBKBO14920 756 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR37L1O60883 481 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOP08100 348 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMP2P13473 410 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ALDH1A3P47895 512 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 VAMP7P51809 220 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MYL6P60660 151 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 MYL7Q01449 175 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCB1Q12824 385 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 BIRC3Q13489 604 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 IQCEQ6IPM2 695 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 OSTM1Q86WC4 334 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 ADSSL1Q8N142 457 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA18Q8TC71 538 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 CORO1BQ9BR76 489 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 HSFX1Q9UBD0 423 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SCN1AP35498 2009 aa22.65■■□□□ 1.22
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ATICP31939 592 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TUFMP49411 452 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPY1Q01534 308 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM31Q5JXX7 168 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNK12Q9HB15 430 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH7Q9ULB5 785 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 YIPF1Q9Y548 306 aa22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 CETN3O15182 167 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT13P13646 458 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 EPHB3P54753 998 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 PLD1Q13393 1074 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC9BQ8N6N2 239 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 FGF13Q92913 245 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 TSG101Q99816 390 aa22.63■■□□□ 1.21
SH3BP4-204ENST00000416021 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.63■■□□□ 1.21
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