RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 HERPUD2Q9BSE4 406 aa25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CALCAP01258 141 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ADCY8P40145 1251 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CNGA2Q16280 664 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCDC25Q86WR0 208 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCDC197Q8NCU1 140 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TCP11Q8WWU5 503 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 KAT2BQ92831 832 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 PCYT2Q99447 389 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TMEM191CA6NGB0 347 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 FAM189A1O60320 539 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TMEM191BP0C7N4 346 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 STAT5BP51692 787 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TAS2R40P59535 323 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCDC50Q8IVM0 306 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 FAXDC2Q96IV6 333 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ACTL7BQ9Y614 415 aa25.19■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 H0YHG0 523 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ABHD2P08910 425 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ATG4AQ8WYN0 398 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCDC77Q9BR77 488 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 PCDHGC3Q9UN70 934 aa25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 MSCO60682 206 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 KLRC2P26717 231 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 INHBEP58166 350 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 Q3C1V9 767 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 NIPA2Q8N8Q9 360 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCT6BQ92526 530 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCDC114Q96M63 670 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 OSBPL7Q9BZF2 842 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 THSD7BQ9C0I4 1608 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 OGTO15294 1046 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CNTN2Q02246 1040 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 STAT4Q14765 748 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 METTL7BQ6UX53 244 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TMEM35BQ8NCS4 154 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.17■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 TJP3O95049 919 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CFHP08603 1231 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 OSBPP22059 807 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CHKAP35790 457 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 SREBF2Q12772 1141 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 DUOXA2Q1HG44 320 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 FAM84AQ96KN4 292 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 FAM212AQ96EL1 285 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 NINJ2Q9NZG7 142 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 SAMD15Q9P1V8 674 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 SMIM23A6NLE4 172 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 EDN1P05305 212 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 GSTA1P08263 222 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 PASD1Q8IV76 773 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PMS1-205ENST00000409985 CCT8L1PA6NM43 557 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 LIASO43766 372 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 CDH16O75309 829 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 LGR5O75473 907 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 ACSL3O95573 720 aa25.14■■□□□ 1.61
PMS1-205ENST00000409985 SLCO1A2P46721 670 aa25.14■■□□□ 1.61
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