RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 LAMP2P13473 410 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 LILRA4P59901 499 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ROR1Q01973 937 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 NELFBQ8WX92 580 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF516Q92618 1163 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 SIX4Q9UIU6 781 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 DUSP12Q9UNI6 340 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 WDFY4Q6ZS81 3184 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 SYN3O14994 580 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CETN3O15182 167 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D4O60343 1298 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ITGB3P05106 788 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 TNNI1P19237 187 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 FSHRP23945 695 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
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GNPTAB-202ENST00000392919 SLC8B1Q6J4K2 584 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP29.25■■■□□ 2.27
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GNPTAB-202ENST00000392919 CTNND2Q9UQB3 1225 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR27A2RRH5 827 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 M0QZQ0 153 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 TNNC2P02585 160 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 SCN1AP35498 2009 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ARPP19P56211 112 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 DLG4P78352 724 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CLDN10P78369 228 aa29.24■■■□□ 2.27
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GNPTAB-202ENST00000392919 TCF15Q12870 199 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 TTI2Q6NXR4 508 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM186BQ8IYM0 893 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC44A3Q8N4M1 653 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 TMC2Q8TDI7 906 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHB8Q9UN66 801 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 AGAP1Q9UPQ3 857 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 UVSSAQ2YD98 709 aa29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 C1orf220Q5T0J3 134 aa29.23■■■□□ 2.27
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GNPTAB-202ENST00000392919 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM105Q8N8V8 129 aa29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 BORCS6Q96GS4 357 aa29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 MKNK1Q9BUB5 465 aa29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 FBXL5Q9UKA1 691 aa29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 NOTCH4Q99466 2003 aa29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 XYLBO75191 536 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ABLIM3O94929 683 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 PAX3P23760 479 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 TAF6P49848 677 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 STX17P56962 302 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 RBP5P82980 135 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 PAK1Q13153 545 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 DSTYKQ6XUX3 929 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF461Q8TAF7 563 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ITFG1Q8TB96 612 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 SENP8Q96LD8 212 aa29.22■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 KRT19P08727 400 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 VAMP7P51809 220 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 CTXN3Q4LDR2 81 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC52Q8N7C0 313 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 MLKLQ8NB16 471 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF560Q96MR9 790 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 PHOX2BQ99453 314 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 MFSD1Q9H3U5 465 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-202ENST00000392919 BICDL2A1A5D9 508 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 ANHXE9PGG2 379 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 H7C4K7 107 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 SEC24AO95486 1093 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 CFHP08603 1231 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 NPR3P17342 541 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 PNPLA4P41247 253 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRP12P59046 1061 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 HTR4Q13639 388 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC183Q5T5S1 534 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 FGF13Q92913 245 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
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GNPTAB-202ENST00000392919 FBXL21Q9UKT6 434 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 CDH7Q9ULB5 785 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
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GNPTAB-202ENST00000392919 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 CST3P01034 146 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
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GNPTAB-202ENST00000392919 EPB41P11171 864 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 AP3M2P53677 418 aa29.19■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 ENPEPQ07075 957 aa29.19■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 BFSP1Q12934 665 aa29.19■■■□□ 2.26
GNPTAB-202ENST00000392919 DPCR1Q3MIW9 517 aa29.19■■■□□ 2.26
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