RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379599.6

NHLRC3-201, Transcript of NHL repeat containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLRC3, Length 3,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3-201ENST00000379599 KRT2P35908 639 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ETV3P41162 512 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 LRRC63Q05C16 580 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TCIRG1Q13488 830 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PDK1Q15118 436 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PDK4Q16654 411 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 SMU1Q2TAY7 513 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 BRSK2Q8IWQ3 736 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 SYCE1Q8N0S2 351 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ELMOD1Q8N336 334 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 DTX3Q8N9I9 347 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 KIF1BO60333 1816 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 USP31Q70CQ4 1352 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 FCHO1O14526 889 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 MAGEB2O15479 319 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CDH16O75309 829 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CETPP11597 493 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CES1P23141 567 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 JAK1P23458 1154 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 MYBPC1Q00872 1141 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 AAGABQ6PD74 315 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 BORAQ6PGQ7 559 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 C8orf48Q96LL4 319 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 HAUS8Q9BT25 410 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 GPAMQ9HCL2 828 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 IFT52Q9Y366 437 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa8.93□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CCRL2O00421 344 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PODXLO00592 558 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TM7SF2O76062 418 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 KCNJ1P48048 391 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TPTEP56180 551 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 XIAPP98170 497 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 STK11Q15831 433 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 AADACL2Q6P093 401 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TTC5Q8N0Z6 440 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 IL17REQ8NFR9 667 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 HES6Q96HZ4 224 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PLK2Q9NYY3 685 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 MYO1DO94832 1006 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 RHOBTB3O94955 611 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 KRT10P13645 584 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 IRX4P78413 519 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 LLGL1Q15334 1064 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 KSR2Q6VAB6 950 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 DEPDC4Q8N2C3 294 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 BTBD9Q96Q07 612 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 TRABDQ9H4I3 376 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 A0A1B0GTW7 788 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 PP2D1A8MPX8 630 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CFAP99D6REC4 459 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 CAMTA2O94983 1202 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 H2AFZP0C0S5 128 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 RAG1P15918 1043 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 NELFEP18615 380 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 S100A5P33763 92 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ETFBP38117 255 aa8.92□□□□□ -0.98
NHLRC3-201ENST00000379599 ZAP70P43403 619 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms