RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379370.6

AGRN-201, Transcript of agrin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AGRN, Length 7,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-201ENST00000379370 ANKS6Q68DC2 871 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 APPL1Q9UKG1 709 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SERPINI2O75830 405 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 DPP3Q9NY33 737 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 AP1G2O75843 785 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 RCAN1P53805 252 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 MAGED4Q96JG8 741 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 NR1D1P20393 614 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 C1orf146Q5VVC0 180 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 AKT1S1Q96B36 256 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TIPINQ9BVW5 301 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 RAB23Q9ULC3 237 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 V9GYQ6 96 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 FKBP9O95302 570 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ERO1BQ86YB8 467 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 FAM161BQ96MY7 647 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 AGPAT1Q99943 283 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TRIM4Q9C037 500 aa14.94□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 MMEP08473 750 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 DPYDQ12882 1025 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SBK1Q52WX2 424 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 RABGGTAQ92696 567 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ZNF521Q96K83 1311 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 FOXN1O15353 648 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 IL18RAPO95256 599 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ALDH2P05091 517 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 EFEMP1Q12805 493 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 IFNEQ86WN2 208 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SPATA18Q8TC71 538 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ESYT3A0FGR9 886 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TSPAN3O60637 253 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 CAP2P40123 477 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ZNF609O15014 1411 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ADM5C9JUS6 153 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 EGFRP00533 1210 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 GTF2H1P32780 548 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TAF6P49848 677 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SENP2Q9HC62 589 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 DDIT4Q9NX09 232 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 FAM205CA6NFA0 338 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 F5H5T6 163 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 SKIP12755 728 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 THEGQ9P2T0 379 aa14.93□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 HEATR9A2RTY3 570 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TMED1Q13445 227 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 CYB561D2O14569 222 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 RHOBTB1O94844 696 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 EPHB2P29323 1055 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 MAP3K7CLP57077 242 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ARID5BQ14865 1188 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 TASP1Q9H6P5 420 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 DIP2BQ9P265 1576 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 M0QYT0 321 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 CYP7B1O75881 506 aa14.92□□□□□ -0.02
AGRN-201ENST00000379370 PYGBP11216 843 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms