RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.07■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 SEC24CP53992 1094 aa22.06■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.06■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.06■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 IPMKQ8NFU5 416 aa22.04■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.04■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
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SMURF1-201ENST00000361125 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 FCGRTP55899 365 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 SOX10P56693 466 aa22.03■■□□□ 1.12
SMURF1-201ENST00000361125 KDSRQ06136 332 aa22.03■■□□□ 1.12
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