RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 LONP2Q86WA8 852 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC33Q8N5R6 958 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 H0Y626 953 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FAM162AQ96A26 154 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 GOLPH3Q9H4A6 298 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 LRG1P02750 347 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ITPK1Q13572 414 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PDK1Q15118 436 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CHST13Q8NET6 341 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 DPP3Q9NY33 737 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CDYLQ9Y232 598 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CHUKO15111 745 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CST8O60676 142 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP9O95302 570 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP9P1Q75LS8 142 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF555Q8NEP9 628 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB14O75071 495 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 AGTP01019 485 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 KLRK1P26718 216 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RSPH10BP0C881 870 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RALBP11234 206 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 YY1P25490 414 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 AVPR1AP37288 418 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RABGAP1LQ5R372 815 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 V9GYQ6 96 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SRP72O76094 671 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FAM200BP0CF97 657 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 NIF3L1Q9GZT8 377 aa23.37■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 AIM2O14862 343 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.332e-6■■□□□ 12.9
PTPRM-201ENST00000332175 EPB42P16452 691 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PLA2G4AP47712 749 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA8P53708 1063 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SCFD2Q8WU76 684 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RHOBTB1O94844 696 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 NR1I3Q14994 352 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 UGP2Q16851 508 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 TFR2Q9UP52 801 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RAD51CO43502 376 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 GRIN3BO60391 1043 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 MAN1A2O60476 641 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 POLBP06746 335 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CYGBQ8WWM9 190 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 KCNJ1P48048 391 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC4FQ8N1N0 589 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PAK5Q9P286 719 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.36■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 EHD2Q9NZN4 543 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 MDH1P40925 334 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 SERPINB9P50453 376 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 BTKQ06187 659 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CSF1RP07333 972 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 TAF6P49848 677 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CENPAP49450 140 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CDH18Q13634 790 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 LAMC2Q13753 1193 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 STX19Q8N4C7 294 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 KRT35Q92764 455 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 TBX20Q9UMR3 447 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.35■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FEZF2Q8TBJ5 459 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 CPB2Q96IY4 423 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 VCAM1P19320 739 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 FCGRTP55899 365 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ARMC6Q6NXE6 501 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 JAMLQ86YT9 394 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 RSAD1Q9HA92 442 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 ODC1P11926 461 aa23.34■■□□□ 1.33
PTPRM-201ENST00000332175 MAGEA4P43358 317 aa23.34■■□□□ 1.33
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