RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 H0YCG3 227 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-201ENST00000311626 CDH16O75309 829 aa26.79■■□□□ 1.88
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HOXB3-201ENST00000311626 NAMPTP43490 491 aa26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-201ENST00000311626 WDR4P57081 412 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HOXB3-201ENST00000311626 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
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HOXB3-201ENST00000311626 DNAJC24Q6P3W2 148 aa26.78■■□□□ 1.88
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HOXB3-201ENST00000311626 MAML1Q92585 1016 aa26.77■■□□□ 1.88
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HOXB3-201ENST00000311626 CCDC77Q9BR77 488 aa26.77■■□□□ 1.88
HOXB3-201ENST00000311626 LGALS13Q9UHV8 139 aa26.77■■□□□ 1.88
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HOXB3-201ENST00000311626 STXBP2Q15833 593 aa26.76■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 ZBED8Q8IZ13 594 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 RCOR2Q8IZ40 523 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 SGK1O00141 431 aa26.76■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 GJB1P08034 283 aa26.75■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 RAP1GAPP47736 663 aa26.75■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 IMPG2Q9BZV3 1241 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 L3MBTL1Q9Y468 752 aa26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.75■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 PIM2Q9P1W9 311 aa26.75■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa26.74■■□□□ 1.87
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HOXB3-201ENST00000311626 TJP3O95049 919 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 KRT15P19012 456 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 MAP2K2P36507 400 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 CETN2P41208 172 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF132P52740 706 aa26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
HOXB3-201ENST00000311626 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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