RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC78A2IDD5 438 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 RBP3P10745 1247 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CHI3L2Q15782 390 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 GPD1LQ8N335 351 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TEX9Q8N6V9 391 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SLC17A7Q9P2U7 560 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 USP1O94782 785 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ACTL9Q8TC94 416 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SLC5A4Q9NY91 659 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 KRT37O76014 449 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 AP2B1P63010 937 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ASPHQ12797 758 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 RIPK1Q13546 671 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 RASA2Q15283 850 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 KLHL38Q2WGJ6 581 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CCNJLQ8IV13 435 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 DCLK2Q8N568 766 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 VPS11Q9H270 941 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 EBF2Q9HAK2 575 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NFIBO00712 420 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ZBED1O96006 694 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SLC1A1P43005 524 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 Q4G0T1 1027 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 GLIS1Q8NBF1 620 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PIDD1Q9HB75 910 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PARVAQ9NVD7 372 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PIK3CDO00329 1044 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 FCHO1O14526 889 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 DNAJC6O75061 913 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CDH6P55285 790 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TTC7BQ86TV6 843 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 MAGEC3Q8TD91 643 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 HSD17B14Q9BPX1 270 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 MECRQ9BV79 373 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TBX20Q9UMR3 447 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NOP56O00567 594 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PDE5AO76074 875 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PROSCO94903 275 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NPTX2P47972 431 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 RARRES1P49788 294 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NRLP54845 237 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 IGBP1P78318 339 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 LAMB3Q13751 1172 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 BLMHQ13867 455 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 PCGF5Q86SE9 256 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 FEZF2Q8TBJ5 459 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TSNARE1Q96NA8 513 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CENPKQ9BS16 269 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 LRRC19Q9H756 370 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 C7orf31Q8N865 590 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 ATP2A3Q93084 1043 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SENP1Q9P0U3 644 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NEMP1O14524 444 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 DGKIO75912 1065 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 AQP5P55064 265 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 CCNG2Q16589 344 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 EML3Q32P44 896 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 MMEL1Q495T6 779 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 HYIQ5T013 277 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA18Q8TC71 538 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms