RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 CENPTQ96BT3 561 aa20.38■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.38■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ACKR2O00590 384 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 KRT10P13645 584 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CETN2P41208 172 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ASPAP45381 313 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TFDP1Q14186 410 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 LONRF1Q17RB8 773 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 PWWP2AQ96N64 755 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 XYLT2Q9H1B5 865 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.37■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 F8VP50 259 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 OGDHQ02218 1023 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CCDC38Q502W7 563 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 EFCAB12Q6NXP0 572 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 FZD8Q9H461 694 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 POLIQ9UNA4 740 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 IFT88Q13099 833 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 MFSD5Q6N075 450 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ERICH1Q86X53 443 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CCDC89Q8N998 374 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 GGA2Q9UJY4 613 aa20.36■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 C5orf60A6NFR6 353 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 B4GALT4O60513 344 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TTC4O95801 387 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 KRT19P08727 400 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CXCL8P10145 99 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TMEM192Q8IY95 271 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 MINDY3Q9H8M7 445 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CEP83Q9Y592 693 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 HBP1O60381 514 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 DRD4P21917 467 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 RAP1GAPP47736 663 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 KYNUQ16719 465 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CDT1Q9H211 546 aa20.35■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 KLRC2P26717 231 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 SLC26A2P50443 739 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 BBOF1Q8ND07 529 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 LIASO43766 372 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CPP00450 1065 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 CD19P15391 556 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 OSBPP22059 807 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 IGBP1P78318 339 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 PPIL2Q13356 520 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 MOGSQ13724 837 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 LRRC38Q5VT99 294 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.34■□□□□ 0.85
USP21-201ENST00000289865 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms