RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 GMCL1Q96IK5 515 aa22.78■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.78■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 RSAD1Q9HA92 442 aa22.78■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.78■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 TMEM150BA6NC51 233 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 ORC1Q13415 861 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 DRC3Q9H069 523 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 TTC36A6NLP5 189 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 RSPH3Q86UC2 560 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 KAT5Q92993 513 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 TNFRSF25Q93038 417 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 ACP6Q9NPH0 428 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 PAK5Q9P286 719 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 TRAPPC3O43617 180 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 APOEP02649 317 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 KCNA3P22001 575 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 E2F7Q96AV8 911 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 NSL1Q96IY1 281 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.77■■□□□ 1.24
USP12-201ENST00000282344 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 RXRBP28702 533 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SLC12A3P55017 1021 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MST1RQ04912 1400 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TISP43B9A030 160 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PROSCO94903 275 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ICAM1P05362 532 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SLURP2P0DP57 97 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 IL1R1P14778 569 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 LRRC6Q86X45 466 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 OR6P1Q8NGX9 317 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MAGEB18Q96M61 343 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 YY1AP1Q9H869 796 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PSTPIP1O43586 416 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PDGFRBP09619 1106 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TTC39CQ8N584 583 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.76■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CES2O00748 559 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PAMP19021 973 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 RARRES1P49788 294 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 DEUP1Q05D60 604 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CHI3L2Q15782 390 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TRIP10Q15642 601 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 DNAL1Q4LDG9 190 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 USP20Q9Y2K6 914 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MED21Q13503 144 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ZNF280CQ8ND82 737 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CXorf38Q8TB03 319 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.75■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ZNF263O14978 683 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MAFGO15525 162 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 RBP5P82980 135 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 RCN1Q15293 331 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PRKCIP41743 596 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 CCNG2Q16589 344 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ABI1Q8IZP0 508 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 SATB1Q01826 763 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 FUKQ8N0W3 1084 aa22.73■■□□□ 1.23
USP12-201ENST00000282344 ACTL9Q8TC94 416 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms