RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000274605.5

N4BP3-201, Transcript of NEDD4 binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene N4BP3, Length 6,080 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3-201ENST00000274605 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 AP3B1O00203 1094 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SNX17Q15036 470 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 EHD2Q9NZN4 543 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 KRT72Q14CN4 511 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 GNASQ5JWF2 1037 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 YIPF2Q9BWQ6 316 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PAK5Q9P286 719 aa18.75■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 C2CD2LO14523 706 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ZNF263O14978 683 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ACADSBP45954 432 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 THAP2Q9H0W7 228 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ZBTB17Q13105 803 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 STYK1Q6J9G0 422 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 BHMTQ93088 406 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 KLC4Q9NSK0 619 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SCFD2Q8WU76 684 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 RSAD1Q9HA92 442 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 FOXP2O15409 715 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PDK1Q15118 436 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 C10orf120Q5SQS8 335 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 NOTUMQ6P988 496 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 NUDT18Q6ZVK8 323 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SNX31Q8N9S9 440 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ACER1Q8TDN7 264 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 TMEM106CQ9BVX2 250 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 FAM47DPA6NHR8 397 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PJA2O43164 708 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 C2CD6Q53TS8 623 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ATP6V1E1P36543 226 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CASP4P49662 377 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 LRRC74AQ0VAA2 488 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 IFNEQ86WN2 208 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PGBD3Q8N328 593 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ANKEF1Q9NU02 776 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PCDHB8Q9UN66 801 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 NUMBP49757 651 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SERPINB9P50453 376 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 GRB10Q13322 594 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ARHGEF7Q14155 803 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ANKS3Q6ZW76 656 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 USP38Q8NB14 1042 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 STKLD1Q8NE28 680 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ADNPQ9H2P0 1102 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PCSK1P29120 753 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 DPP3Q9NY33 737 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 MED24O75448 989 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SGPL1O95470 568 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 OCM2P0CE71 109 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CETPP11597 493 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 HUNKP57058 714 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 FOPNLQ96NB1 174 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 MAP3K14Q99558 947 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 APOL5Q9BWW9 433 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 MAFGO15525 162 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 RBP3P10745 1247 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 TRADDQ15628 312 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 UGP2Q16851 508 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 SGO1Q5FBB7 561 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 FAXCQ5TGI0 409 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CYFIP2Q96F07 1278 aa18.73■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 POLBP06746 335 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 LVRNQ6Q4G3 990 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ZIM3Q96PE6 472 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 DGKIO75912 1065 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 MROH9Q5TGP6 573 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 CHSY1Q86X52 802 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 AIM2O14862 343 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.72■□□□□ 0.59
N4BP3-201ENST00000274605 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms