RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257604.9

TRAFD1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene TRAFD1, Length 3,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-201ENST00000257604 LRRD1A4D1F6 860 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DNM1LO00429 736 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PHKA2P46019 1235 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RPL21P46778 160 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF844Q08AG5 666 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CCL14Q16627 93 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C12orf29Q8N999 325 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GIMAP7Q8NHV1 300 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 KIF12Q96FN5 646 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NIF3L1Q9GZT8 377 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CYP1A2P05177 515 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ADCY8P40145 1251 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PEX5P50542 639 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CCDC33Q8N5R6 958 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ERP44Q9BS26 406 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 OSBPL7Q9BZF2 842 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RAB17Q9H0T7 212 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ADCY6O43306 1168 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CTNNA2P26232 953 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ECHS1P30084 290 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PTENP60484 403 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NOMO3P69849 1222 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MAMLD1Q13495 774 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TAPT1Q6NXT6 567 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CPLX4Q7Z7G2 160 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RASGEF1CQ8N431 466 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 WHAMMQ8TF30 809 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TWNKQ96RR1 684 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CEP83Q9Y592 693 aa15.5■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GMNCA6NCL1 334 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HCRTO43612 131 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NPTXRO95502 500 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C22orf31O95567 290 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MYL3P08590 195 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HOXC6P09630 235 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 LAMC2Q13753 1193 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZPBP2Q6X784 338 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TAX1BP1Q86VP1 789 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RUBCNQ92622 972 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 UVRAGQ9P2Y5 699 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CLGNO14967 610 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 KRT1P04264 644 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SHBGP04278 402 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PSEN1P49768 467 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 KRT17Q04695 432 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ADCY2Q08462 1091 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GRIK4Q16099 956 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 RNF169Q8NCN4 708 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SEMA4AQ9H3S1 761 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SNTG2Q9NY99 539 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.49■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GOLGA8MH3BSY2 632 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PDGFRBP09619 1106 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 CALCOCO2Q13137 446 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 WDR49Q8IV35 697 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C1orf127Q8N9H9 656 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 MGARPQ8TDB4 240 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 C2orf40Q9H1Z8 148 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAFD1-201ENST00000257604 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms