RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 ADAM22Q9P0K1 906 aa22.49■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.49■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PTGESO14684 152 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 GPR182O15218 404 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 MGEA5O60502 916 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 MTA2O94776 668 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 KCNE1P15382 129 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 NDST1P52848 882 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 LPIN1Q14693 890 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC66A2RUB6 948 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 DPH6Q7L8W6 267 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.48■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PTP4A2Q12974 167 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PAK2Q13177 524 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PIRO00625 290 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 SPTLC1O15269 473 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 GJB6O95452 261 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 COMTP21964 271 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 MLH1P40692 756 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 GAD1Q99259 594 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 CHST12Q9NRB3 414 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 ANAPC7Q9UJX3 599 aa22.47■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PAEPP09466 180 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PAFAH1B1P43034 410 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PRMT2P55345 433 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 INCA1Q0VD86 236 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PCDHGC3Q9UN70 934 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 NME7Q9Y5B8 376 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 CEP104O60308 925 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 ITGA4P13612 1032 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 MMP8P22894 467 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.46■■□□□ 1.19
RFXAP-201ENST00000255476 HCRTO43612 131 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 CD4P01730 458 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 MYBL1P10243 752 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 MARCKSL1P49006 195 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 RNF169Q8NCN4 708 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 KRT35Q92764 455 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 TRIM11Q96F44 468 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 CKBP12277 381 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 SOWAHAQ2M3V2 549 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 C12orf29Q8N999 325 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 ALG3Q92685 438 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 PNKPQ96T60 521 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 MIOSQ9NXC5 875 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.45■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 MAMLD1Q13495 774 aa22.44■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 MTFR1Q15390 333 aa22.44■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 LIN9Q5TKA1 542 aa22.44■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.44■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 FAM26DQ5JW98 314 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 VCPIP1Q96JH7 1222 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 PBKQ96KB5 322 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 ADAM2Q99965 735 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 KPNA7A9QM74 516 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 MED7O43513 233 aa22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms