RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 JOSD2Q8TAC2 188 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CPXM1Q96SM3 734 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KRT12Q99456 494 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 EDEM3Q9BZQ6 932 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 BPTFQ12830 3046 aa7.01□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 B3GAT3O94766 335 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ALDH1A1P00352 501 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 NSFP46459 744 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ATP11AP98196 1134 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ADCY2Q08462 1091 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 AGMOQ6ZNB7 445 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF280BQ86YH2 543 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CXorf38Q8TB03 319 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 WHAMMQ8TF30 809 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ERVK-5Q9HDB9 667 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CTAGE15A4D2H0 777 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 LCA5LO95447 670 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CTAGE8P0CG41 777 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KRT10P13645 584 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 OGDHQ02218 1023 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RPS6KA1Q15418 735 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CTAGE6Q86UF2 777 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC50Q8IVM0 306 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CTAGE4Q8IX94 777 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 DBF4BQ8NFT6 615 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GPR152Q8TDT2 470 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 IFT81Q8WYA0 676 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MCEEQ96PE7 176 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 FAM105AQ9NUU6 356 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 JRKLQ9Y4A0 524 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 FRYLO94915 3013 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PQY0 241 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 FGGP02679 453 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CYP2C18P33260 490 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CLCN6P51797 869 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RAD23BP54727 409 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PTPN20Q4JDL3 420 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 WSCD1Q658N2 575 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM209Q96SK2 561 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SYNCQ9H7C4 482 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KCND1Q9NSA2 647 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF446Q9NWS9 450 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 AMACRQ9UHK6 382 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PTPN22Q9Y2R2 807 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 A8MXQ7 604 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 M0QYV0 167 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 M0QZ92 97 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 FKTNO75072 461 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 BEST1O76090 585 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GYS2P54840 703 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 DYNLT1P63172 113 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 FAM193AP78312 1265 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CLDN10P78369 228 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CBX1P83916 185 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 GCNT1Q02742 428 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 LPIN1Q14693 890 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SOWAHAQ2M3V2 549 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TCTN1Q2MV58 587 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 RNF180Q86T96 592 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 PDCL2Q8N4E4 241 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SLC4A11Q8NBS3 891 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SPATA4Q8NEY3 305 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ADAM32Q8TC27 787 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ERO1AQ96HE7 468 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 NUP205Q92621 2012 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 ANKRD62A6NC57 917 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 KIF4AO95239 1232 aa6.99□□□□□ -1.29
CNIH1-201ENST00000216416 MCF2P10911 925 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms