RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 YwhagP61982 247 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acvrl1Q61288 502 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpatch2lQ6PE65 482 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ttc39bQ8BYY4 617 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Adgra1Q8C4G9 578 aa16.9■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm4841E9QAA8 417 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx3O70492 162 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PigrO70570 771 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rab20P35295 233 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp11aP98197 1187 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tff2Q03404 129 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cyp2c67Q569X9 491 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Xlr3cQ61806 226 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mcph1Q7TT79 822 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Creb3l2Q8BH52 521 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Snx30Q8CE50 437 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Thap12Q9CUX1 758 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mphosph6Q9D1Q1 161 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gins2Q9D600 185 aa16.89■□□□□ 0.3
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mical3Q8CJ19 1993 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Galnt4O08832 578 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ThbdP15306 577 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nub1P54729 614 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sesn2P58043 480 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Erbb2P70424 1256 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Edem3Q2HXL6 931 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb16Q3UQ17 673 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Uts2bQ765I1 113 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rhot1Q8BG51 631 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf365Q8BG89 408 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf467Q8JZL0 594 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arfip2Q8K221 341 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc39a3Q99K24 317 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C130060K24RikG3UWA8 416 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcna3P16390 528 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tnni3P48787 211 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Serping1P97290 504 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gsdmc4Q3TR54 480 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cage1Q5IR70 849 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ush1gQ80T11 461 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 EtnpplQ8BWU8 499 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trappc12Q8K2L8 797 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tgif2lx2Q8K5B9 231 aa16.89■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd70O55237 195 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Irf8P23611 424 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rad54lP70270 747 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdk16Q04735 496 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam8a1Q3URQ4 399 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anapc5Q8BTZ4 740 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tbrg4Q91YM4 630 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phrf1A6H619 1682 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mia3Q8BI84 1930 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tekt5G5E8A8 557 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rb1P13405 921 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rasgrf1P27671 1262 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tarbp2P97473 365 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3UTZ3 580 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Anapc7Q9WVM3 565 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ubr3Q5U430 1889 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AunipE9Q6Z5 340 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bace1P56818 501 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Actr2P61161 394 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PapolaQ61183 739 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc39a13Q8BZH0 361 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atad3Q925I1 591 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Taf7lQ9D3R9 471 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdk2Q9JK42 407 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rnf25Q9QZR0 456 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc22a3Q9WTW5 551 aa16.88■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plxnb2B2RXS4 1842 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AspgA0JNU3 564 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Capn6O35646 641 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sult1d1Q3UZZ6 295 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atl2Q6PA06 583 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nde1Q9CZA6 344 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pdcd2P46718 343 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Crybg3Q80W49 1005 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tcaf1Q8BNE1 924 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RbakQ8BQC8 711 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc7a14Q8BXR1 771 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc15a2Q9ES07 729 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 XkQ9QXY7 446 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 RpgrQ9R0X5 1001 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cap1P40124 474 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppm1jQ149T7 507 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mylk3Q3UIZ8 795 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf652Q5DU09 608 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 B3gnt3Q5JCS9 372 aa16.87■□□□□ 0.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Akr1c14Q91WT7 323 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.2 ms