RNA–Protein interactions for RNA: YMR014W

BUD22, Transcript of Protein required for rRNA maturation and ribosomal subunit biogenesis, yeast

Gene BUD22, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BUD22	YMR014W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	APA2	P22108	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	CPR5	P35176	225 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	UPS2	P35200	230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU13	P38725	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	HSP10	P38910	106 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RFC2	P40348	353 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	VMA21	P41806	77 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU10	Q03050	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RIM9	Q04734	239 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	FSH2	Q05015	223 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU20	Q08322	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	VPS63	O13549	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	HEM4	P06174	275 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YOX1	P34161	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SDH4	P37298	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PSD1	P39006	500 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PCL7	P40186	285 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	PHB1	P40961	287 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	XPT1	P47165	209 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	DAN1	P47178	298 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	GEP7	P53171	287 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	CGR1	P53188	120 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YGR026W	P53217	278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YAP1802	P53309	568 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ACS1	Q01574	713 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YPS3	Q12303	508 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ROX3	P25046	220 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ATG15	P25641	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	AHT1	P29589	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SPS18	P32572	300 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	NSE4	P43124	402 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YGR050C	P53231	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	HSK3	P69852	69 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	DCS1	Q06151	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	CTR3	Q06686	241 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YFH1	Q07540	174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SWT1	Q12104	458 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	DAL3	P32459	195 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	TCA17	P32613	152 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	MTC6	P38849	526 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	YEL057C	P39983	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	ALG12	P53730	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	LPP1	Q04396	274 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
BUD22	YMR014W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BUD22	YMR014W	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	PAU19	P0CE85	124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	PAU21	P0CE86	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	PAU22	P0CE87	164 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	YCR025C	P25352	136 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	PAU3	P25610	124 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	AFR1	P33304	620 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	BNS1	P50084	137 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	UBC13	P52490	153 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	PIN2	Q12057	282 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	ATG5	Q12380	294 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	YOP1	Q12402	180 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.08	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	SPO13	P23624	291 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	FPR2	P32472	135 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	SDH8	P38345	138 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	SEN34	P39707	275 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	YGR269W	P40326	108 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	RTS2	P40962	232 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	HCH1	P53834	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	APS2	Q00381	147 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	AVO2	Q04749	426 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	SOR2	Q07786	357 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.07	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	FCY2	P17064	533 aa		4.06	□□□□□ -1.76
BUD22	YMR014W	MRS4	P23500	304 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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