RNA–Protein interactions for RNA: YJR087W

YJR087W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJR087W, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJR087W	YJR087W	YER134C	P40081	178 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJR087W	YJR087W	SHH3	Q04487	196 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJR087W	YJR087W	YPR013C	Q12145	317 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YJR087W	YJR087W	SFK1	P35735	353 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	FIT2	Q08906	153 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	YAR023C	D6VPM8	179 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	CNB1	P25296	175 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	ARO7	P32178	256 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	MRPL15	P36523	253 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	IKI1	P38874	309 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	SER2	P42941	309 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	YDR391C	Q04170	232 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	RNH202	Q05635	350 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	GGA1	Q06336	557 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	PHO85	P17157	305 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	UGX2	P32772	223 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	MSS2	P40990	351 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	BNA7	Q04066	261 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	UBC8	P28263	218 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	MTW1	P39731	289 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	0.67	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	MET31	Q03081	177 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	AHT1	P29589	182 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	PAM17	P36147	197 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	YBR242W	P38331	238 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	YLR036C	Q07986	203 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YJR087W	YJR087W	FMP49	A0A023PZB3	126 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	TAF14	P35189	244 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	CUP9	P41817	306 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YNL033W	P53964	284 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YLR031W	Q07978	186 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	TIR1	P10863	254 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	MGT1	P26188	188 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.64	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		0.64	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	SNF4	P12904	322 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YHL037C	P38733	133 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	PGA2	P53903	129 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YMR253C	Q04835	414 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.63	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	HTB2	P02294	131 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	MRS1	P07266	363 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YCR023C	P25351	611 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YIL102C	P40488	101 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	FYV12	Q08559	129 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	GET4	Q12125	312 aa		0.62	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	SEN2	P16658	377 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	SPC25	P40014	221 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	TDA4	P47153	279 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	VPS71	Q03433	280 aa		0.61	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YFL051C	P43552	160 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	NAT3	Q06504	195 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		0.6	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	SBH2	P52871	88 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	MMS2	P53152	137 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	FIT1	Q04433	528 aa		0.59	□□□□□ -2.31
YJR087W	YJR087W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	ARG80	P07249	177 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	YAR064W	P39563	99 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	DCV1	P43595	202 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	YGL235W	P53071	178 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	CCW12	Q12127	133 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	YOR015W	Q12169	119 aa		0.58	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	STF2	P16965	84 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	YBL010C	P32788	280 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	GRX5	Q02784	150 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	PIR1	Q03178	341 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	DGK1	Q12382	290 aa		0.57	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	NTG1	P31378	399 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	YFL019C	P43576	117 aa		0.56	□□□□□ -2.32
YJR087W	YJR087W	YNL184C	P53876	108 aa		0.56	□□□□□ -2.32

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