RNA–Protein interactions for RNA: YER171W

RAD3, Transcript of 5' to 3' DNA helicase, yeast

Gene RAD3, Length 2,337 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD3	YER171W	ERG25	P53045	309 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	HED1	Q03937	162 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RAF1	Q06891	181 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YOR292C	Q08743	309 aa		5	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	CLB6	P32943	380 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	SDH4	P37298	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	PIG2	P40187	538 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	PRM5	P40476	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	HXT14	P42833	540 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	EGT2	P42835	1041 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	WSC3	Q12215	556 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	SPO13	P23624	291 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	MRPL4	P36517	319 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	CDS1	P38221	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YDL183C	P48569	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YIP5	P53108	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	PDR17	P53844	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	UPS1	Q05776	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	FCY22	Q12119	530 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	POF1	P25576	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	LDB16	P25587	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	CDC50	P25656	391 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	LAC1	P28496	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YKL070W	P36087	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	PHB1	P40961	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	XPT1	P47165	209 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	BNS1	P50084	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	TAF4	P50105	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YGL262W	P53054	175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YGL185C	P53100	379 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RNH203	Q12338	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	DGK1	Q12382	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	WSS1	P38838	269 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	GEP7	P53171	287 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RAD28	Q12021	506 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	AHT1	P29589	182 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YBR013C	P38215	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	SIP18	P50263	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	PAU4	P53427	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	WSC2	P53832	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	HSK3	P69852	69 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YDC1	Q02896	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RIP1	P08067	215 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	RTS2	P40962	232 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	USV1	Q12132	391 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
RAD3	YER171W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
RAD3	YER171W	SEC62	P21825	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	MAK32	P23060	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	POP5	P28005	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	MIA40	P36046	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	CUE1	P38428	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PHS1	P40857	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU1	P0CE88	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU14	P0CE89	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU6	P0CE90	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU18	P0CE91	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU8	P0CE92	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU11	P0CE93	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	MOH1	P38191	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU13	P38725	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	SEN34	P39707	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU15	P40585	124 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	TAX4	P47030	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	TTI2	P47168	421 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	UBC13	P52490	153 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YGR050C	P53231	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	FYV6	P53913	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU10	Q03050	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	CTR3	Q06686	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	HRD1	Q08109	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU20	Q08322	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	PAU9	Q3E770	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	HEM4	P06174	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	CDC7	P06243	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	FCY2	P17064	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	SEC59	P20048	519 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YGR269W	P40326	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YGR045C	P53229	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ERV2	Q12284	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	BOL1	Q3E793	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD3	YER171W	ROX3	P25046	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.8 ms