RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640634.1

SCARB2-222, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5

Gene SCARB2, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-222	ENST00000640634	NCAPH	Q15003	741 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	GPATCH11	Q8N954	259 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	POLI	Q9UNA4	740 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	LINC01565	O15544	149 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	CTSA	P10619	480 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	FGFR3	P22607	806 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	GLUD2	P49448	558 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	SURF1	Q15526	300 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	ZACN	Q401N2	412 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	SUSD3	Q96L08	255 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	DACH1	Q9UI36	760 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	LZTS1	Q9Y250	596 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SCARB2-222	ENST00000640634	VCAN	P13611	3396 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	LILRB3	O75022	631 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	CXCL14	O95715	111 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	NRIP1	P48552	1158 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	TAF6	P49848	677 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	UBE3A	Q05086	875 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	NCOA4	Q13772	614 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	PTPRO	Q16827	1216 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	SENP8	Q96LD8	212 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	L1RE1	Q9UN81	338 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	PLXNA3	P51805	1871 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	KPNA7	A9QM74	516 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634		M0QZQ0	153 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	PHACTR2	O75167	634 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	UROD	P06132	367 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	CCDC192	P0DO97	292 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	RAP1GAP	P47736	663 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	MXI1	P50539	228 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	RBP5	P82980	135 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	APBA1	Q02410	837 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	DSG1	Q02413	1049 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	HYAL1	Q12794	435 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	USP41	Q3LFD5	358 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	WSCD1	Q658N2	575 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	IGFLR1	Q9H665	355 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	CYB561D2	O14569	222 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	IKBKB	O14920	756 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	TEX28	O15482	410 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	SPATA31D3	P0C874	917 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	MYL5	Q02045	173 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	PSMD5	Q16401	504 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SCARB2-222	ENST00000640634	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53

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