RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	NTRK1	P04629	796 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	XBP1	P17861	261 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	LGALS4	P56470	323 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF22	Q14807	665 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MROH9	Q5TGP6	573 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	LIN54	Q6MZP7	749 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CABP7	Q86V35	215 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	HERVK_113	Q902F9	699 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	HTRA1	Q92743	480 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MUL1	Q969V5	352 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	RILPL2	Q969X0	211 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MRGBP	Q9NV56	204 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MYOM1	P52179	1685 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP12	Q02952	1782 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	PXDN	Q92626	1479 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PPH5	198 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	FYB1	O15117	783 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MTA2	O94776	668 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CYBB	P04839	570 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	KIT	P10721	976 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	FNTB	P49356	437 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CREM	Q03060	361 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	FGL2	Q14314	439 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	NR1I3	Q14994	352 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SEPT2	Q15019	361 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	TIGD6	Q17RP2	521 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC157	Q569K6	752 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	NETO2	Q8NC67	525 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	DPF2	Q92785	391 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CD244	Q9BZW8	370 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF10	O15013	1369 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP12B	A6NM10	295 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ISM1	B1AKI9	464 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	BRAF	P15056	766 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	FGFR2	P21802	821 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A1	P30825	629 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXO4	P98177	505 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	MALL	Q13021	153 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	RPTN	Q6XPR3	784 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	SDF4	Q9BRK5	362 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		5.62	□□□□□ -1.51
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		5.62	□□□□□ -1.51

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