RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 SPG21Q9NZD8 308 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 MTUS1Q9ULD2 1270 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 POLIQ9UNA4 740 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.14□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
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SGMS1-211ENST00000626236 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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SGMS1-211ENST00000626236 FAM171A1Q5VUB5 890 aa9.12□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.12□□□□□ -0.95
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SGMS1-211ENST00000626236 EPHB6O15197 1021 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-211ENST00000626236 CSPG5O95196 566 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-211ENST00000626236 CA8P35219 290 aa9.11□□□□□ -0.95
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SGMS1-211ENST00000626236 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 ERVK-21P61565 698 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 PLCB3Q01970 1234 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 GCNT1Q02742 428 aa9.11□□□□□ -0.95
SGMS1-211ENST00000626236 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.11□□□□□ -0.95
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