RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TMX3Q96JJ7 454 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRF-216ENST00000617451 HEPACAM2A8MVW5 462 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ARNTLO00327 626 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 PPEF2O14830 753 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF131P52739 623 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 EPHB3P54753 998 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 LILRA4P59901 499 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MYBPC2Q14324 1141 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA1Q5VX52 437 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 OVOS1Q6IE37 1185 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CENPPQ6IPU0 288 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MYCT1Q8N699 235 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 IER2Q9BTL4 223 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 NCOR2Q9Y618 2525 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0B4J269 797 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PRU2 124 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 TDGF1P13385 188 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 UBA7P41226 1012 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH1A3P47895 512 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 RSPRY1Q96DX4 576 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CALML4Q96GE6 196 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 LMAN1LQ9HAT1 526 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 PARVGQ9HBI0 331 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 K7ENM7 598 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 FAM13AO94988 1023 aa27.05■■□□□ 1.92
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC39A4Q6P5W5 647 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CD302Q8IX05 232 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ATAD1Q8NBU5 361 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 SENP8Q96LD8 212 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MSTO1Q9BUK6 570 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MTMR11A4FU01 709 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 TRAK2O60296 914 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 PAX3P23760 479 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 JADE1Q6IE81 842 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 FIZ1Q96SL8 496 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ASB3Q9Y575 518 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CHRNB1P11230 501 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ODC1P11926 461 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CCNE1P24864 410 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 NRLP54845 237 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 FCHO2Q0JRZ9 810 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MCM6Q14566 821 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf57Q5W0N0 161 aa27.03■■□□□ 1.92
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PTPRF-216ENST00000617451 TTC9BQ8N6N2 239 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 FAM212AQ96EL1 285 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM209Q96SK2 561 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 CHADO15335 359 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 PLCG1P19174 1290 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 GTF2BQ00403 316 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 PPP2R5DQ14738 602 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 STXBP5Q5T5C0 1151 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 GAREM2Q75VX8 874 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 RAD54LQ92698 747 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 PSMG2Q969U7 264 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MSANTD3Q96H12 275 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 MKNK1Q9BUB5 465 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 HSFX1Q9UBD0 423 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 DERAQ9Y315 318 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRF-216ENST00000617451 ANO9A1A5B4 782 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 PIRO00625 290 aa27.01■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 NFICP08651 508 aa27.01■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 SOAT2O75908 522 aa27■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP11A1P05108 521 aa27■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 LONP1P36776 959 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
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PTPRF-216ENST00000617451 GPIHBP1Q8IV16 184 aa27■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC3BQ96PB8 259 aa27■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 ATXN3LQ9H3M9 355 aa27■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 ZHX3Q9H4I2 956 aa27■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 SMC3Q9UQE7 1217 aa27■■□□□ 1.91
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD63C9JTQ0 380 aa26.99■■□□□ 1.91
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