RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 NATD1Q8N6N6 113 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PLIN2Q99541 437 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PSME4Q14997 1843 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TRIM49BA6NDI0 452 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PSMA7O14818 248 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ZBTB39O15060 712 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ZBTB5O15062 677 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SLC37A4O43826 429 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 GREM1O60565 184 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SERPINB7O75635 380 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 DDHD2O94830 711 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ANP32DO95626 131 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PYGMP11217 842 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 EPB42P16452 691 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 VAMP1P23763 118 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 KRT9P35527 623 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PPP1R2P41236 205 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 GRB10Q13322 594 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 CALCRLQ16602 461 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 AMHR2Q16671 573 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SYDE2Q5VT97 1194 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 IL23RQ5VWK5 629 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 KCTD16Q68DU8 428 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 RAD9BQ6WBX8 426 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 HID1Q8IV36 788 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 HACE1Q8IYU2 909 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SGK3Q96BR1 496 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 VPS16Q9H269 839 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SDHAF3Q9NRP4 125 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PQC6 194 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TGFB2P61812 414 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 AP1B1Q10567 949 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 MTF1Q14872 753 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 C2CD5Q86YS7 1000 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 IFT43Q96FT9 208 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 FAM167AQ96KS9 214 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 FBXL18Q96ME1 805 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PNMA5Q96PV4 448 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 CALN1Q9BXU9 219 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 NTN4Q9HB63 628 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 NYAP2Q9P242 653 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 STK17AQ9UEE5 414 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 USP20Q9Y2K6 914 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 E9PMD0 336 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 E2F3O00716 465 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 RASGRP1O95267 797 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TDP2O95551 362 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 RETP07949 1114 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TXKP42681 527 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PPP2R2AP63151 447 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 PROX2Q3B8N5 592 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 MAJINQ3KP22 176 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 KIFC2Q96AC6 838 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 CALML4Q96GE6 196 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-244ENST00000602516 THAP1Q9NVV9 213 aa8.05□□□□□ -1.12
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