RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CLTA	P09496	248 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CCR3	P51677	355 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CDR1	P51861	262 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	NCKAP1L	P55160	1127 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SPEM2	Q0P670	501 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR17	Q13304	367 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ARSH	Q5FYA8	562 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GAREM2	Q75VX8	874 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	IER2	Q9BTL4	223 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	EML5	Q05BV3	1969 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	LACTBL1	A8MY62	500 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAMEF12	O95522	483 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	NEFL	P07196	543 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G4B	P0C869	781 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP3A5	P20815	502 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	FNTB	P49356	437 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SMTN	P53814	917 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP8	P85298	464 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPP	Q6IPU0	288 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC8	Q8TAM2	541 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	BICD1	Q96G01	975 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	REEP2	Q9BRK0	252 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		12.98	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6C75	A6NL08	312 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ESF4	209 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CHAD	O15335	359 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	NFIC	P08651	508 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CTH	P32929	405 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CXCL12	P48061	93 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHB3	P54753	998 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	NRL	P54845	237 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PLD1	Q13393	1074 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	USP37	Q86T82	979 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNN1	Q92952	543 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMG2	Q969U7	264 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR88	Q9GZN0	384 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		12.97	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	TISP43	B9A030	160 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	HR	O43593	1189 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PIGR	P01833	764 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ADRB2	P07550	413 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ATF6	P18850	670 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	TYMP	P19971	482 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SDHB	P21912	280 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRR2	P28476	465 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	ALDH1A3	P47895	512 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	LIG4	P49917	911 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	LILRA4	P59901	499 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4F8	P98187	520 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	TNK2	Q07912	1038 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	MYBPC2	Q14324	1141 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA1	Q5VX52	437 aa		12.96	□□□□□ -0.33
TTLL3-233	ENST00000602338	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33

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