RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	GPR158	Q5T848	1215 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560		Q6ZUG5	572 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	LEMD2	Q8NC56	503 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	MDM1	Q8TC05	714 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PIGK	Q92643	395 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	BRF1	Q92994	677 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	FAM20A	Q96MK3	541 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DPYSL4	O14531	572 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SYN3	O14994	580 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ATG13	O75143	517 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	GALK1	P51570	392 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DGKE	P52429	567 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SEMA3B	Q13214	749 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DMC1	Q14565	340 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	UROC1	Q96N76	676 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	POLD4	Q9HCU8	107 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	RAX	Q9Y2V3	346 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.31	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560		H7C4K7	107 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DTNB	O60941	627 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	LYPLA2	O95372	231 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	APBB3	O95704	486 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CPB1	P15086	417 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	IFNAR1	P17181	557 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DUSP4	Q13115	394 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	XKR4	Q5GH76	650 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SYT13	Q7L8C5	426 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DDX12P	Q92771	950 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TSC2	P49815	1807 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ACKR2	O00590	384 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ENG	P17813	658 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	GABRR2	P28476	465 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PTGER3	P43115	390 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	MCM2	P49736	904 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	OSTN	P61366	133 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	RUNX3	Q13761	415 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	IL21	Q9HBE4	155 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	TENM4	Q6N022	2769 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	AAMP	Q13685	434 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NUP62-216	ENST00000599560	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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