RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594202.5

FCHO1-206, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-206ENST00000594202 SOCS7O14512 581 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 PPP2R2AP63151 447 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 MTMR3Q13615 1198 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 RUFY4Q6ZNE9 571 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 GDAP1Q8TB36 358 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 TWNKQ96RR1 684 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ZBTB42B2RXF5 422 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 GPR25O00155 361 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 RGS7P49802 495 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 TAF5Q15542 800 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 NLRP7Q8WX94 980 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 RAPGEF5Q92565 580 aa16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 PROSCO94903 275 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ATG7O95352 703 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ATF2P15336 505 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 CHN1P15882 459 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 FAM187AA6NFU0 413 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 H0YCG3 227 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 GJA5P36382 358 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 CENPCQ03188 943 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ERICH1Q86X53 443 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ERO1BQ86YB8 467 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 HCRTO43612 131 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 PPFIA2O75334 1257 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 KIZQ2M2Z5 673 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 SESTD1Q86VW0 696 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 HSPH1Q92598 858 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 F5H423 210 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 OGTO15294 1046 aa16.08■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 ICAM3P32942 547 aa16.08■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 GAD2Q05329 585 aa16.08■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 P3H1Q32P28 736 aa16.08■□□□□ 0.17
FCHO1-206ENST00000594202 VGLL3A8MV65 326 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 CD48P09326 243 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 RTP1P59025 263 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 FBXW10Q5XX13 1052 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 JADE1Q6IE81 842 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 ARMCX2Q7L311 632 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 C12orf29Q8N999 325 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 NETO2Q8NC67 525 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 DCLK3Q9C098 648 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 CDT1Q9H211 546 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 CYTH4Q9UIA0 394 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 LACTBL1A8MY62 500 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 RASGRF2O14827 1237 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 STAM2O75886 525 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 TNNC2P02585 160 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 BPIFB4P59827 614 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 SKOR1P84550 965 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 PLVAPQ9BX97 442 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 NIF3L1Q9GZT8 377 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 EPN3Q9H201 632 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-206ENST00000594202 H0YHG0 523 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms