RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 RMDN3Q96TC7 470 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ALG1Q9BT22 464 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 MYL10Q9BUA6 226 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR11Q9BZH6 1224 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC26A4O43511 780 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ADAMTS4O75173 837 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 LRIG2O94898 1065 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RXRAP19793 462 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RPS6KB1P23443 525 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 EDNRBP24530 442 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD17B4P51659 736 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RCAN1P53805 252 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP2R5DQ14738 602 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 DUSP28Q4G0W2 176 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 APOA5Q6Q788 366 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RUFY3Q7L099 469 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 DIO2Q92813 273 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TP53INP1Q96A56 240 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 FERMT2Q96AC1 680 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 DNM3Q9UQ16 869 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 INVSQ9Y283 1065 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 LAMA4Q16363 1823 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ASTN1O14525 1302 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ELP1O95163 1332 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 CABYRO75952 493 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 DLGAP3O95886 979 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ASGR1P07306 291 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 CPA1P15085 419 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ACLYP53396 1101 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PHC1P78364 1004 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 BIRC3Q13489 604 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL4Q14679 1199 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 BROXQ5VW32 411 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SCFD2Q8WU76 684 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF141Q8WVD5 230 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 CUL5Q93034 780 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 OXSMQ9NWU1 459 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 MYH6P13533 1939 aa8.6□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM3APO60318 1980 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 AP1G1O43747 822 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 SOD2P04179 222 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM163BP0C2L3 166 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TGFB3P10600 412 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 EVCP57679 992 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 RTP1P59025 263 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP12P59046 1061 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 BTKQ06187 659 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR16Q569H4 304 aa8.59□□□□□ -1.03
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.59□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms