RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584550.1

GGA3-219, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-219	ENST00000584550	DPYSL4	O14531	572 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	OSTN	P61366	133 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	MAPK6	Q16659	721 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	FAM187B	Q17R55	369 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	PLK5	Q496M5	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	BSND	Q8WZ55	320 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	E2F7	Q96AV8	911 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	UROC1	Q96N76	676 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	ITPR1	Q14643	2758 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550		H7C4K7	107 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	ACKR2	O00590	384 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	PODXL	O00592	558 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	CAVIN2	O95810	425 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	OR52Z1	P0C646	297 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	CPB1	P15086	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	PDC	P20941	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	TRAPPC10	P48553	1259 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	EPHA5	P54756	1037 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	TPGS2	Q68CL5	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	CEP120	Q8N960	986 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	LEMD2	Q8NC56	503 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	GPR88	Q9GZN0	384 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-219	ENST00000584550	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SYN3	O14994	580 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	LYPLA2	O95372	231 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	OR4Q2	P0C623	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SYT1	P21579	422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GBP1	P32455	592 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DEFB124	Q8NES8	71 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TMEM209	Q96SK2	561 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	LRRC3	Q9BY71	257 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	YIPF1	Q9Y548	306 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	PATE3	B3GLJ2	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ATG13	O75143	517 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	RHOBTB1	O94844	696 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	EGF	P01133	1207 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CEACAM1	P13688	526 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MCM4	P33991	863 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CDR1	P51861	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DUSP4	Q13115	394 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ELF2	Q15723	593 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	GPR158	Q5T848	1215 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	ZNF280D	Q6N043	979 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	TMC8	Q8IU68	726 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DDX12P	Q92771	950 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-219	ENST00000584550	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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