RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 SV2CQ496J9 727 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 OLIG1Q8TAK6 271 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 KANSL3Q9P2N6 904 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CSF2RAP15509 400 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 UPP1Q16831 310 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 REXO1L1PQ8IX06 675 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM199Q8N511 208 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 SLC20A1Q8WUM9 679 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CACNG4Q9UBN1 327 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 LRFN2Q9ULH4 789 aa25■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CASTOR2A6NHX0 329 aa24.99■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 PODXLO00592 558 aa24.99■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC39CQ8N584 583 aa24.99■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 URGCPQ8TCY9 931 aa24.99■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 NAGPAQ9UK23 515 aa24.99■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CILPO75339 1184 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNFAIP3P21580 790 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CDR2Q01850 454 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 INCA1Q0VD86 236 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF394Q53GI3 561 aa24.98■■□□□ 1.59
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ABI1Q8IZP0 508 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CHRNB2P17787 502 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 SOWAHAQ2M3V2 549 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 UROC1Q96N76 676 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAAF1Q9BRP4 392 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 HOXA2O43364 376 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 PFKMP08237 780 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 GNA15P30679 374 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 DSC1Q08554 894 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAF3Q5VWG9 929 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF677Q86XU0 584 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 WHAMMQ8TF30 809 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 NENFQ9UMX5 172 aa24.97■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CALCAP01258 141 aa24.96■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 MMEP08473 750 aa24.96■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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RARA-AS1-201ENST00000581080 LIMS2Q7Z4I7 341 aa24.96■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.96■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 CASD1Q96PB1 797 aa24.96■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 A0A0U1RQJ8 604 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 DDHD2O94830 711 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 VAV2P52735 878 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 RAD23BP54727 409 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 DPH6Q7L8W6 267 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 KIAA1328Q86T90 577 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 PALB2Q86YC2 1186 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF280BQ86YH2 543 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 RABGGTAQ92696 567 aa24.95■■□□□ 1.59
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RARA-AS1-201ENST00000581080 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
RARA-AS1-201ENST00000581080 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
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RARA-AS1-201ENST00000581080 TACC1O75410 805 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 B3GAT3O94766 335 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 PAEPP09466 180 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF662Q6ZS27 426 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 TOP6BLQ8N6T0 577 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 APPL2Q8NEU8 664 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 TWNKQ96RR1 684 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 HMGXB4Q9UGU5 601 aa24.95■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 HUS1O60921 280 aa24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 NDST1P52848 882 aa24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.94■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 RCCD1A6NED2 376 aa24.93■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 CYB561D2O14569 222 aa24.93■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 B4GALT3O60512 393 aa24.93■■□□□ 1.58
RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM163BP0C2L3 166 aa24.93■■□□□ 1.58
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