RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 DAW1Q8N136 415 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 BEST2Q8NFU1 509 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 MKNK1Q9BUB5 465 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 ATXN3LQ9H3M9 355 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM134Q9H6X4 195 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 EML5Q05BV3 1969 aa19.12■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 FRYQ5TBA9 3013 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 RPP40O75818 363 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC192P0DO97 292 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 ALDH1A3P47895 512 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SLC10A6Q3KNW5 377 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 STPG1Q5TH74 334 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 GAREM2Q75VX8 874 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 TTC9BQ8N6N2 239 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 GAB3Q8WWW8 586 aa19.11■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 TM4SF5O14894 197 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SLC16A4O15374 487 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 EPN2O95208 641 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 PRAMEF12O95522 483 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF806P0C7X5 589 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 CXCL8P10145 99 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 MUTP22033 750 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 GABRR2P28476 465 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 CDR1P51861 262 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 CYP4F8P98187 520 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 USP37Q86T82 979 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SNX29Q8TEQ0 813 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 RUSC1Q9BVN2 902 aa19.1■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 ATG2BQ96BY7 2078 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 MTMR11A4FU01 709 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 E9PMD0 336 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 M0QZQ0 153 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 OAZ2O95190 189 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 HOXA6P31267 233 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SHC2P98077 582 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 TTC38Q5R3I4 469 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 DSTYKQ6XUX3 929 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 ATAD1Q8NBU5 361 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 BPIFB1Q8TDL5 484 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM209Q96SK2 561 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 LRWD1Q9UFC0 647 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 ANK1P16157 1881 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 TSC2P49815 1807 aa19.09■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 MYH11P35749 1972 aa19.08■□□□□ 0.65
CCDC40-211ENST00000574099 SFI1A8K8P3 1242 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RAP1GAPP47736 663 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 GUCY2FP51841 1108 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 MAPK7Q13164 816 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 GPR17Q13304 367 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 NBR1Q14596 966 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 CENPPQ6IPU0 288 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 TCEAL6Q6IPX3 200 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 SYNPOQ8N3V7 929 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 TCEAL3Q969E4 200 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PSMG2Q969U7 264 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 KIF12Q96FN5 646 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 LOXL4Q96JB6 756 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 DRC1Q96MC2 740 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 LPIN3Q9BQK8 851 aa19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 OR6C75A6NL08 312 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 KCNK5O95279 499 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 MPLP40238 635 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 ST3GAL1Q11201 340 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 STRN3Q13033 797 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 OBP2AQ9NY56 170 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 SLC8A2Q9UPR5 921 aa19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PP2D1A8MPX8 630 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 TOM1L1O75674 476 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 LRPAP1P30533 357 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 MCM2P49736 904 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PLCB2Q00722 1185 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PLA2G2CQ5R387 149 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 RNF43Q68DV7 783 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 OVOS1Q6IE37 1185 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 FSTL4Q6MZW2 842 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 ASB3Q9Y575 518 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 LAMA1P25391 3075 aa19.06■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa19.05■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PPEF2O14830 753 aa19.05■□□□□ 0.64
CCDC40-211ENST00000574099 PROS1P07225 676 aa19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms