RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559840.1

CYCSP38-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 38, humanhuman

BASIC

Gene CYCSP38, Length 322 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP38-201ENST00000559840 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SPEGQ15772 3267 aa6.67□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LAMA5O15230 3695 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 A0A1W2PRU2 124 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TTC26A0AVF1 554 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MTMR11A4FU01 709 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MAN2B1O00754 1011 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 NCAM2O15394 837 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CLDN3O15551 220 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SOAT2O75908 522 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 OAZ2O95190 189 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CLTAP09496 248 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PLA2G4BP0C869 781 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PSMC3P17980 439 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SOX9P48436 509 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SMTNP53814 917 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 GAS6Q14393 721 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MCM6Q14566 821 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ZBTB6Q15916 424 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ARSHQ5FYA8 562 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 WDR44Q5JSH3 913 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MCTP1Q6DN14 999 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 Q6ZS52 159 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LEMD2Q8NC56 503 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 FAM3CQ92520 227 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 KCNN1Q92952 543 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 IRF7Q92985 503 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 BICD1Q96G01 975 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 NELL2Q99435 816 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 REEP2Q9BRK0 252 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 IER2Q9BTL4 223 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LRRC3Q9BY71 257 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 KCND2Q9NZV8 630 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MAFFQ9ULX9 164 aa6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ITPR1Q14643 2758 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 OR6C75A6NL08 312 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LACTBL1A8MY62 500 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 K7ENM7 598 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ZNF263O14978 683 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PRAMEF12O95522 483 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PIGRP01833 764 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 NFICP08651 508 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CHRNB1P11230 501 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CYP3A5P20815 502 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TGM1P22735 817 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CCNE1P24864 410 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LIG4P49917 911 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CCR3P51677 355 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ZNF131P52739 623 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SATB1Q01826 763 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LMNB2Q03252 620 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 DMWDQ09019 674 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 DUSP4Q13115 394 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 GPR17Q13304 367 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PLD1Q13393 1074 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LPAL2Q16609 132 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 C8orf34Q49A92 452 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 JADE1Q6IE81 842 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CENPPQ6IPU0 288 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 GAREM2Q75VX8 874 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 GPBP1Q86WP2 473 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 PSMG2Q969U7 264 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 BORCS6Q96GS4 357 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 TMEM209Q96SK2 561 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 FIZ1Q96SL8 496 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CYCSP38-201ENST00000559840 USP18Q9UMW8 372 aa6.65□□□□□ -1.34
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