RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARID3AQ99856 593 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 SDCBP2Q9H190 292 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 L1RE1Q9UN81 338 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYO9BQ13459 2157 aa20.02■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPHB6O15197 1021 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 HUS1O60921 280 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 NOL4O94818 638 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 RB1P06400 928 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TPM3P06753 285 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 WEE2P0C1S8 567 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF75DP51815 510 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT17Q04695 432 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 WSCD1Q658N2 575 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CEP57Q86XR8 500 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARNTL2Q8WYA1 636 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 GANQ9H2C0 597 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.01■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOD2P04179 222 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ODC1P11926 461 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 P4HA1P13674 534 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CUL2Q13617 745 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDCL2Q8N4E4 241 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOP6BLQ8N6T0 577 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 APPL2Q8NEU8 664 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPPL3Q8TCT6 385 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 KREMEN1Q96MU8 473 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 BCO2Q9BYV7 579 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 FHOD1Q9Y613 1164 aa20■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPOPA6NHQ4 379 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 GRM6O15303 877 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP11A1P05108 521 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGFR3P22607 806 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAJB1P25685 340 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 RTP2Q5QGT7 225 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 IQCEQ6IPM2 695 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 DPH6Q7L8W6 267 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 VPS52Q8N1B4 723 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEK11Q8NG66 645 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAJC12Q9UKB3 198 aa19.99■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 SYN3O14994 580 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 UCHL3P15374 230 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TYMPP19971 482 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 GCNT1Q02742 428 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 GPM6BQ13491 265 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP41Q3LFD5 358 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 OSTM1Q86WC4 334 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADGRF2Q8IZF7 708 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 POF1BQ8WVV4 589 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAXDC2Q96IV6 333 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTPALQ9BTX7 342 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CHST7Q9NS84 486 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 NME7Q9Y5B8 376 aa19.98■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 H3BNC9 293 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 HCRTO43612 131 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TACC1O75410 805 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CSPG5O95196 566 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD58P19256 250 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGAP44Q17R89 818 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 OVOS1Q6IE37 1185 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 VSTM4Q8IW00 320 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM86AQ8N2M4 240 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZBP1Q9H171 429 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CYP3A43Q9HB55 503 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 NLRC4Q9NPP4 1024 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 CISHQ9NSE2 258 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 LZTS1Q9Y250 596 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYO7AQ13402 2215 aa19.97■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARHGEF37A1IGU5 675 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 RFXAPO00287 272 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 C2CD2LO14523 706 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 GABRDO14764 452 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADCY5O95622 1261 aa19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 WARSP23381 471 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFAP3P55082 362 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms