RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	GAS6	Q14393	721 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PDIA5	Q14554	519 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	IL17A	Q16552	155 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	USP37	Q86T82	979 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ITIH5	Q86UX2	942 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CEP120	Q8N960	986 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	USP28	Q96RU2	1077 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PLIN2	Q99541	437 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RAB34	Q9BZG1	259 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DNM3	Q9UQ16	869 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		7.46	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CEP250	Q9BV73	2442 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PRU2	124 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688		H0YCG3	227 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TM4SF5	O14894	197 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	AKAP3	O75969	853 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GJA1	P17302	382 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LRPAP1	P30533	357 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CTH	P32929	405 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SMTN	P53814	917 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	AMPD2	Q01433	879 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	STRN3	Q13033	797 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CCIN	Q13939	588 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MYBPC2	Q14324	1141 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KYAT1	Q16773	422 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZPBP2	Q6X784	338 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	BRAP	Q7Z569	592 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PSMG2	Q969U7	264 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	EXOC4	Q96A65	974 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LRRC3	Q9BY71	257 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	YIPF1	Q9Y548	306 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	PATJ	Q8NI35	1801 aa		7.45	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	COL4A3	Q01955	1670 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CACNA1B	Q00975	2339 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ARID2	Q68CP9	1835 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ABLIM1	O14639	778 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CLDN3	O15551	220 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GDF9	O60383	454 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	HIP1R	O75146	1068 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CLTA	P09496	248 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TYMP	P19971	482 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SCP2	P22307	547 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	RAP1GAP	P47736	663 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	MCL1	Q07820	350 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SMARCB1	Q12824	385 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	DUSP4	Q13115	394 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZBTB6	Q15916	424 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	KRT79	Q5XKE5	535 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	CENPP	Q6IPU0	288 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	TMC8	Q8IU68	726 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	GAB3	Q8WWW8	586 aa		7.44	□□□□□ -1.22
CS-233	ENST00000552688	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22

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