RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 H3BUI4 141 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MYO1FO00160 1098 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 GNAT2P19087 354 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ECHS1P30084 290 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 KIR2DL3P43628 341 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 UBE3CQ15386 1083 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MST1LQ2TV78 715 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 FAM209BQ5JX69 171 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 KCNV1Q6PIU1 500 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ZNF354CQ86Y25 554 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ARMT1Q9H993 441 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 BCO1Q9HAY6 547 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.36□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 USP19O94966 1318 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PPL8 197 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 KPNA5O15131 536 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 STC2O76061 302 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 GAAP10253 952 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 PPM1AP35813 382 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 STT3AP46977 705 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 TNFAIP2Q03169 654 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CCDC142Q17RM4 750 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SCLT1Q96NL6 688 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 WDCPQ9H6R7 721 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.35□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 NCK2O43639 380 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP15-218ENST00000552346 TLE1Q04724 770 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SNAPC2Q13487 334 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CNGA2Q16280 664 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 RSPH3Q86UC2 560 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 RNF152Q8N8N0 203 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 SPATA5Q8NB90 893 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP15-218ENST00000552346 OR7D4Q8NG98 312 aa6.34□□□□□ -1.39
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USP15-218ENST00000552346 SUCLG2Q96I99 432 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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USP15-218ENST00000552346 CERS4Q9HA82 394 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 ABCF2Q9UG63 623 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 STAP2Q9UGK3 403 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.34□□□□□ -1.39
USP15-218ENST00000552346 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 MTSS1O43312 755 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 RECQL4O94761 1208 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 IL18RAPO95256 599 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CD53P19397 219 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SREBF1P36956 1147 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 DAG1Q14118 895 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 DACT2Q5SW24 774 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 KIAA1191Q96A73 305 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 ZNF69Q9UC07 566 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PNMA2Q9UL42 364 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.33□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TLR5O60602 858 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PRAMEF4O60810 478 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GASTP01350 101 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 AMY1AP04745 511 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 KITP10721 976 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 TSHRP16473 764 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 SLC7A1P30825 629 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CRHR1P34998 444 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 GRK6P43250 576 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 CCT5P48643 541 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 PER3P56645 1201 aa6.32□□□□□ -1.4
USP15-218ENST00000552346 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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