RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552294.1

CTDSP2-208, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP2, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-208ENST00000552294 IKZF4Q9H2S9 585 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIP11Q15643 1979 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PP2D1A8MPX8 630 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CHADO15335 359 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF40O75150 1001 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MICAL2O94851 1124 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP11B2P19099 503 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PROZP22891 400 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HOXA6P31267 233 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TNFSF9P41273 254 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GRM5P41594 1212 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GUCY1B3Q02153 619 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ACAP1Q15027 740 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 IL17AQ16552 155 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CALCRLQ16602 461 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GPR158Q5T848 1215 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RNF43Q68DV7 783 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CENPPQ6IPU0 288 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LRRTM3Q86VH5 581 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 DEFB124Q8NES8 71 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GIPC2Q8TF65 315 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 BORCS6Q96GS4 357 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CRELD1Q96HD1 420 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SUSD3Q96L08 255 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SLC22A12Q96S37 553 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 EDEM2Q9BV94 578 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TPSD1Q9BZJ3 242 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 EBF3Q9H4W6 596 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GKN1Q9NS71 199 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MTMR11A4FU01 709 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 E9PMD0 336 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HCRTO43612 131 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TADA3O75528 432 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CPB1P15086 417 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 KCNE1P15382 129 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GABRR2P28476 465 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CDC25AP30304 524 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ELF1P32519 619 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NPTX2P47972 431 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GALK1P51570 392 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 IRX4P78413 519 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZXDBP98169 803 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CREB5Q02930 508 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZBTB6Q15916 424 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 MAPK6Q16659 721 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GAB4Q2WGN9 574 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 HACE1Q8IYU2 909 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 C4orf32Q8N8J7 132 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 DEPTORQ8TB45 409 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LRRC15Q8TF66 581 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ASAH2Q9NR71 780 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 CNTN3Q9P232 1028 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 LHX6Q9UPM6 363 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TNFSF13BQ9Y275 285 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ATG2BQ96BY7 2078 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 TISP43B9A030 160 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 M0QZQ0 153 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 ZNF197O14709 1029 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP2-208ENST00000552294 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms