RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 PAX3P23760 479 aa20.18■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 KCNH2Q12809 1159 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF699Q32M78 642 aa20.18■□□□□ 0.82
CTDSP2-207ENST00000551594 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.18■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 DSEQ9UL01 958 aa20.15■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 COL6A3P12111 3177 aa20.14■□□□□ 0.82
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CTDSP2-207ENST00000551594 SPATA31D3P0C874 917 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 EPCAMP16422 314 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 RAP1GAPP47736 663 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 NDUFV1P49821 464 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 CDH8P55286 799 aa20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CTDSP2-207ENST00000551594 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.14■□□□□ 0.81
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