RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 GPR32O75388 356 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 IL18RAPO95256 599 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 F2P00734 622 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TCF4P15884 667 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MFSD10Q14728 455 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TERF2Q15554 542 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 PRELID2Q8N945 189 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ACAP3Q96P50 834 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 GJD2Q9UKL4 321 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC188H7C350 402 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 FLT3P36888 993 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 KCNJ1P48048 391 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.29■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MYADML2A6NDP7 307 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ECHS1P30084 290 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TTC27Q6P3X3 843 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 KIF12Q96FN5 646 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 PPEF2O14830 753 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TLR3O15455 904 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 AKAP5P24588 427 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TAS2R40P59535 323 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ANK1P16157 1881 aa22.28■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CDR1P51861 262 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 RWDD2BP57060 319 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 LIN9Q5TKA1 542 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 USP6NLQ92738 828 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 HPDLQ96IR7 371 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 RARAP10276 462 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MMP8P22894 467 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 PAK2Q13177 524 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 WHAMMQ8TF30 809 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 DPP3Q9NY33 737 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 KLK14Q9P0G3 267 aa22.27■■□□□ 1.16
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC66A2RUB6 948 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6BA6NDN3 693 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 PIK3R2O00459 728 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 RAD23BP54727 409 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 DR1Q01658 176 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 GPS2Q13227 327 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 EMBQ6PCB8 327 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 NRCAMQ92823 1304 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 MYBL1P10243 752 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 TNFRSF8P28908 595 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 PSEN2P49810 448 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 SNX1Q13596 522 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 MCEEQ96PE7 176 aa22.26■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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PRDM4-205ENST00000550376 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA8SH3BPF8 625 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 VIPAS39Q9H9C1 493 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 TRPV1Q8NER1 839 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 ATG4AQ8WYN0 398 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 ASB7Q9H672 318 aa22.25■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 PROSCO94903 275 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 CTNNA2P26232 953 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 OGDHQ02218 1023 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF410Q86VK4 478 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 TRIM11Q96F44 468 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 BCO2Q9BYV7 579 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.24■■□□□ 1.15
PRDM4-205ENST00000550376 RNF39Q9H2S5 420 aa22.24■■□□□ 1.15
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