RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 DPP7Q9UHL4 492 aa4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 MAST3O60307 1309 aa4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZMYM6O95789 1325 aa4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 LAMB4A4D0S4 1761 aa4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 RGPD2P0DJD1 1756 aa4.85□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CPDO75976 1380 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 STK36Q9NRP7 1315 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ERICH2A1L162 156 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ERLIN1O75477 346 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 EFEMP2O95967 443 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PFKFB1P16118 471 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 C5AR1P21730 350 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 AOAHP28039 575 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CASQ1P31415 396 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 AFMP43652 599 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 RCAN1P53805 252 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SLC16A1P53985 500 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PRR5P85299 388 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 FOXO4P98177 505 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SLC39A6Q13433 755 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PICALMQ13492 652 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 UBE3CQ15386 1083 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ELF2Q15723 593 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 LONRF3Q496Y0 759 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 FILIP1LQ4L180 1135 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SYT10Q6XYQ8 523 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 KIF6Q6ZMV9 814 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CNNM3Q8NE01 707 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ALG3Q92685 438 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SMARCE1Q969G3 411 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TTC17Q96AE7 1141 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 MAP3K14Q99558 947 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 KRT23Q9C075 422 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 RNF38Q9H0F5 515 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 SLC39A2Q9NP94 309 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 DTLQ9NZJ0 730 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 USP18Q9UMW8 372 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 FAM50BQ9Y247 325 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 CLIC4Q9Y696 253 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-210ENST00000549362 LAMA4Q16363 1823 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ZBTB43O43298 467 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 URI1O94763 535 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 PCDH8O95206 1070 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 PRLP01236 227 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 FGAP02671 866 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ASGR2P07307 311 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 SYN1P17600 705 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 GNAT2P19087 354 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 MCM3P25205 808 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 LIFRP42702 1097 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 MTNR1BP49286 362 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ERVFRD-1P60508 538 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 TIMM10P62072 90 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 NKX3-2P78367 333 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 GUCY1B3Q02153 619 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 TRIM14Q14142 442 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 MORC3Q14149 939 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 SPIDRQ14159 915 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 GRM3Q14832 879 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 ALX1Q15699 326 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 CCDC93Q567U6 631 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-210ENST00000549362 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms