RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548518.1

SLC8B1-205, Transcript of solute carrier family 8 member B1, human

TSL 4

Gene SLC8B1, Length 664 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC8B1-205	ENST00000548518	PIK3CA	P42336	1068 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ARPP19	P56211	112 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYL7	Q01449	175 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	CETN1	Q12798	172 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	NCOA4	Q13772	614 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF699	Q32M78	642 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	KRT39	Q6A163	491 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TTI2	Q6NXR4	508 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	DPH6	Q7L8W6	267 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	MMS19	Q96T76	1030 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ANO10	Q9NW15	660 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SIX4	Q9UIU6	781 aa		12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	CDH23	Q9H251	3354 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRANK1	O15050	2925 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SPTLC1	O15269	473 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TGM5	O43548	720 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TBX10	O75333	385 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	GLP2R	O95838	553 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	EPCAM	P16422	314 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	GCLM	P48507	274 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	LHX1	P48742	406 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	MXI1	P50539	228 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	DLG4	P78352	724 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TSPY1	Q01534	308 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ITIH3	Q06033	890 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	RAB33A	Q14088	237 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZACN	Q401N2	412 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TPGS2	Q68CL5	300 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF516	Q92618	1163 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TAF4B	Q92750	862 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		12.9	□□□□□ -0.34
SLC8B1-205	ENST00000548518	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	FAM163B	P0C2L3	166 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	PCSK1	P29120	753 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	MYL6	P60660	151 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	ROR1	Q01973	937 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	SMARCB1	Q12824	385 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	KCNC3	Q14003	757 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	CLUL1	Q15846	466 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	STX1A	Q16623	288 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	UVSSA	Q2YD98	709 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	WSCD1	Q658N2	575 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	RTL10	Q7L3V2	364 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	CXorf38	Q8TB03	319 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	FAM84A	Q96KN4	292 aa		12.89	□□□□□ -0.35
SLC8B1-205	ENST00000548518	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		12.89	□□□□□ -0.35

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